Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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