Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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