Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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