Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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