Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TNXAQ16473 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNXAQ16473 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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