Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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