Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms