Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITSN1Q15811 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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