Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCOA1Q15788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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NCOA1Q15788 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCOA1Q15788 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
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