Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SF1Q15637 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SF1Q15637 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SF1Q15637 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SF1Q15637 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SF1Q15637 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SF1Q15637 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SF1Q15637 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SF1Q15637 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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