Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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