Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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