Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SHPRHQ149N8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHPRHQ149N8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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