Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.64
CHD4Q14839 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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