Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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