Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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