Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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