Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SPIDRQ14159 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIDRQ14159 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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