Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms