Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB31Q13636 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms