Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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