Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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