Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms