Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIGQ13278 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIGQ13278 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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