Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SEMA3FQ13275 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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