Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3BQ13214 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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