Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RESTQ13127 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RESTQ13127 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RESTQ13127 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RESTQ13127 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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