Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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