Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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