Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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