Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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CSTF3Q12996 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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