Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 212.03□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 29.5
SF3A3Q12874 PLCG1-210ENST00000483646 591 ntTSL 39.68□□□□□ -0.862e-11■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.716e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 519.71■□□□□ 0.755e-10■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-10■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 TUBG2-202ENST00000588870 1776 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-216ENST00000599488 514 ntTSL 418.89■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-204ENST00000594893 1453 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-215ENST00000599137 608 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-207ENST00000595136 531 ntTSL 414.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-211ENST00000596213 929 ntTSL 313.26□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-205ENST00000595067 548 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-213ENST00000597994 470 ntTSL 410.56□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-218ENST00000600247 583 ntTSL 410.08□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 AKAP8L-210ENST00000596195 553 ntTSL 47.88□□□□□ -1.152e-9■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 GALE-207ENST00000459934 1563 ntTSL 515.83■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 GALE-204ENST00000429356 957 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 GALE-214ENST00000481736 1801 ntTSL 210.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 29.4
SF3A3Q12874 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 512.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FGFR1OP-203ENST00000476078 682 ntTSL 318.71■□□□□ 0.593e-12■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 310.08□□□□□ -0.83e-12■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-209ENST00000489088 745 ntTSL 316.73■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 413.04□□□□□ -0.324e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 POLR2G-202ENST00000524819 1053 ntTSL 311.42□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MAPK12-202ENST00000395778 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 POLR2G-203ENST00000525455 919 ntTSL 310.91□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 29.3
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SF3A3Q12874 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 410.12□□□□□ -0.794e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.884e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-206ENST00000506131 311 ntTSL 59.19□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 29.3
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SF3A3Q12874 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 POLR2G-205ENST00000527435 868 ntTSL 28.34□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 29.3
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SF3A3Q12874 EXOSC8-208ENST00000488779 630 ntTSL 58.26□□□□□ -1.094e-9■■■■■ 29.3
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SF3A3Q12874 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-207ENST00000507863 582 ntTSL 47.38□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-210ENST00000490537 2423 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.354e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.374e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 POLR2G-204ENST00000526368 710 ntTSL 26.07□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-211ENST00000495092 818 ntTSL 35.47□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 55.38□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 ARHGAP12-210ENST00000497103 732 ntTSL 35.18□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.614e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 54.92□□□□□ -1.624e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 54.9□□□□□ -1.634e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-201ENST00000239893 694 ntTSL 54.61□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 34.18□□□□□ -1.744e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-203ENST00000464235 614 ntTSL 34.15□□□□□ -1.754e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.814e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 EXOSC8-204ENST00000470423 208 ntTSL 51.13□□□□□ -2.234e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 ACSL3-205ENST00000421680 639 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 ITIH3-204ENST00000464804 543 ntTSL 415.04■□□□□ -01e-12■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 29.3□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 SEMA4G-206ENST00000518124 596 ntTSL 315.25■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 513.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 DOCK6-205ENST00000586702 1249 ntTSL 216.45■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 MYO5C-205ENST00000558902 3074 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 VARS-219ENST00000461328 662 ntTSL 313.77□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 TRIM15-209ENST00000477944 426 ntTSL 31.31□□□□□ -2.23e-7■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 529.07■■■□□ 2.243e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.043e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 225.05■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 516.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 29.3
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