Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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