Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREBF2Q12772 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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