Protein–RNA interactions for Protein: Q12421

ATG31, Autophagy-related protein 31, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG31Q12421 SMC1YFL008W 3678 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 SAS3YBL052C 2496 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 PXA2YKL188C 2562 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 KAP120YPL125W 3099 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YGR130CYGR130C 2451 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YKL044WYKL044W 321 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YML003WYML003W 873 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 IRC23YOR044W 474 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 IRC16YPR038W 360 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 SCW11YGL028C 1629 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 CDC39YCR093W 6327 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 RIM20YOR275C 1986 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 RPL16AYIL133C 600 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 HIT1YJR055W 495 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 SVS1YPL163C 783 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 GUP1YGL084C 1683 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 FIG4YNL325C 2640 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 AIM9YER080W 1884 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 snR78snR78 87 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 CYC7YEL039C 342 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 TMA22YJR014W 597 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 RUF22RUF22 515 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YNL319WYNL319W 441 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 APQ13YJL075C 417 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 YDL206WYDL206W 2289 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 SET3YKR029C 2256 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG31Q12421 MMS4YBR098W 2076 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 UPS1YLR193C 528 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 ERP4YOR016C 624 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 SLY1YDR189W 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 STO1YMR125W 2586 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 MET32YDR253C 576 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YJR141WYJR141W 1044 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 HCH1YNL281W 462 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 PDE2YOR360C 1581 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YLL032CYLL032C 2478 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 IFH1YLR223C 3258 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YDL016CYDL016C 303 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 ANS1YHR126C 480 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 RFX1YLR176C 2436 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 APL2YKL135C 2181 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 LCD1YDR499W 2244 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 NUP157YER105C 4176 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 OCA6YDR067C 675 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YFL012WYFL012W 447 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YIL059CYIL059C 366 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YGL239CYGL239C 315 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 MRPL31YKL138C 396 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YOR199WYOR199W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 RCN2YOR220W 798 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 YAP3YHL009C 993 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 snR13snR13 124 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG31Q12421 SLI15YBR156C 2097 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 MXR1YER042W 555 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YGR025WYGR025W 303 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 RRT1YBL048W 312 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 RPL32YBL092W 393 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 TSC3YBR058C-A 243 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 ROM2YLR371W 4071 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 ALY2YJL084C 3141 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 ENV11YGR071C 2583 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YDR269CYDR269C 324 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 HUR1YGL168W 333 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 NBL1YHR199C-A 222 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 UBX4YMR067C 1251 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 SNU56YDR240C 1479 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 EFR3YMR212C 2349 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 WAR1YML076C 2835 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 NPC2YDL046W 522 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 RPS27AYKL156W 249 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 TTI1YKL033W 3117 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 PHS1YJL097W 654 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 SLD3YGL113W 2007 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YDL196WYDL196W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 RTT102YGR275W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YKL123WYKL123W 381 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 UBP3YER151C 2739 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG31Q12421 ALG13YGL047W 609 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 URM1YIL008W 300 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 IES4YOR189W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 ZIP2YGL249W 2115 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YDR029WYDR029W 315 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YER135CYER135C 393 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 BIG1YHR101C 1008 nt0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.1 ms