Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 PEP3YLR148W 2757 nt2.34□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 VMR1YHL035C 4779 nt2.34□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 VPS54YDR027C 2670 nt2.34□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 PHO91YNR013C 2685 nt2.34□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 snR74snR74 88 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 RPL42BYHR141C 321 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 RPL42AYNL162W 321 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YBR277CYBR277C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 CBF2YGR140W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 PXA2YKL188C 2562 nt2.33□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 BNI1YNL271C 5862 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 INP2YMR163C 2118 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 snR85snR85 171 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YOR376WYOR376W 369 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SEC16YPL085W 6588 nt2.32□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SMC6YLR383W 3345 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YEL043WYEL043W 2871 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YBL083CYBL083C 426 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 RPB10YOR210W 213 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 snR48snR48 113 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YFR016CYFR016C 3702 nt2.31□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YPR097WYPR097W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 DNF1YER166W 4716 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 UBP2YOR124C 3819 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 MSB1YOR188W 3414 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YGR164WYGR164W 336 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SNC1YAL030W 354 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 MUK1YPL070W 1839 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 RGA1YOR127W 3024 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 RIC1YLR039C 3171 nt2.3□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 STH1YIL126W 4080 nt2.29□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 GIS1YDR096W 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 UFD4YKL010C 4452 nt2.29□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 LRE1YCL051W 1752 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 SWI6YLR182W 2412 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 NUP120YKL057C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 snR72snR72 98 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 MNL2YLR057W 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
TAF3Q12297 NUP100YKL068W 2880 nt2.28□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 KAP123YER110C 3342 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 INO80YGL150C 4470 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YLR012CYLR012C 300 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YNL114CYNL114C 372 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 RRP6YOR001W 2202 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SAP185YJL098W 3177 nt2.27□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 MPT5YGL178W 2580 nt2.26□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 STB4YMR019W 2850 nt2.26□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SCH9YHR205W 2475 nt2.26□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.26□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 COF1YLL050C 432 nt2.26□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SWI5YDR146C 2130 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 EMC6YLL014W 327 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 COX14YML129C 213 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SGF11YPL047W 300 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 RPH1YER169W 2391 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 CRM1YGR218W 3255 nt2.25□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SPO22YIL073C 2928 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 ULI1YFR026C 510 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YOR218CYOR218C 420 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 snR46snR46 197 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 SLN1YIL147C 3663 nt2.24□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 RPS27BYHR021C 249 nt2.23□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 PAU8YAL068C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 PAU20YOL161C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 FKS3YMR306W 5358 nt2.23□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 PDR11YIL013C 4236 nt2.23□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 CLN3YAL040C 1743 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 ELG1YOR144C 2376 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 VTC1YER072W 390 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 snR43snR43 209 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 TFC3YAL001C 3483 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 RFX1YLR176C 2436 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 UBR1YGR184C 5853 nt2.22□□□□□ -2.05
TAF3Q12297 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.21□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SLY1YDR189W 2001 nt2.2□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SCP160YJL080C 3669 nt2.2□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SET2YJL168C 2202 nt2.2□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 DGR1YNL130C-A 147 nt2.2□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 SLM1YIL105C 2061 nt2.2□□□□□ -2.06
TAF3Q12297 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.19□□□□□ -2.06
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