Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms