Protein–RNA interactions for Protein: Q08622

GEP3, Genetic interactor of prohibitins 3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEP3Q08622 RTT10YPL183C 3042 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 SSQ1YLR369W 1974 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YDR286CYDR286C 345 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 ULI1YFR026C 510 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 SNC2YOR327C 348 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YBR277CYBR277C 402 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 VPS54YDR027C 2670 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 SRO77YBL106C 3033 nt2.12□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 NOP53YPL146C 1368 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 RPO41YFL036W 4056 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 MSB2YGR014W 3921 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 snR74snR74 88 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 RRP6YOR001W 2202 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 PLC1YPL268W 2610 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 AXL1YPR122W 3627 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 CBF2YGR140W 2871 nt2.11□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 VPS35YJL154C 2835 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 CUL3YGR003W 2235 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 TCB2YNL087W 3537 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 FMP16YDR070C 282 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 PAU8YAL068C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 PAU20YOL161C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YLR149CYLR149C 2193 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 YPL216WYPL216W 3309 nt2.1□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 VPS34YLR240W 2628 nt2.09□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 GRR1YJR090C 3456 nt2.09□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 KTI11YBL071W-A 249 nt2.09□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 snR46snR46 197 nt2.09□□□□□ -2.07
GEP3Q08622 MUK1YPL070W 1839 nt2.08□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SEF1YBL066C 3447 nt2.08□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YBR184WYBR184W 1572 nt2.08□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPS27BYHR021C 249 nt2.08□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.08□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SMY1YKL079W 1971 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YLL007CYLL007C 1998 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SEC26YDR238C 2922 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 NOP10YHR072W-A 177 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 INP2YMR163C 2118 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 ELG1YOR144C 2376 nt2.07□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SPF1YEL031W 3648 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 FKS3YMR306W 5358 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPB10YOR210W 213 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YOR218CYOR218C 420 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 AFI1YOR129C 2682 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 UBR1YGR184C 5853 nt2.06□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 PDR3YBL005W 2931 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SWI6YLR182W 2412 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPL34BYIL052C 366 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 SGF11YPL047W 300 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YPL150WYPL150W 2706 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 TAE2YPL009C 3117 nt2.05□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 PEP3YLR148W 2757 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RAV1YJR033C 4074 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 CLN3YAL040C 1743 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 PXA2YKL188C 2562 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPS17AYML024W 411 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 MLH1YMR167W 2310 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 snR43snR43 209 nt2.04□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 ESL2YKR096W 3588 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YEL073CYEL073C 324 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPL42BYHR141C 321 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 RPL42AYNL162W 321 nt2.03□□□□□ -2.08
GEP3Q08622 MCM10YIL150C 1716 nt2.03□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 SPO22YIL073C 2928 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 snR72snR72 98 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YBL109WYBL109W 336 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 DNF1YER166W 4716 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 SCP160YJL080C 3669 nt2.02□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 KAP123YER110C 3342 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 IST2YBR086C 2841 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YPR097WYPR097W 3222 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 RIC1YLR039C 3171 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 STE11YLR362W 2154 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 MPT5YGL178W 2580 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 ECM12YHR021W-A 456 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 SNC1YAL030W 354 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 PRP42YDR235W 1635 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 GIP3YPL137C 3831 nt2.01□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 RTT101YJL047C 2529 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 TRL1YJL087C 2484 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 SAP185YJL098W 3177 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 CDC60YPL160W 3273 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 SNU13YEL026W 381 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 YBL053WYBL053W 375 nt2□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 UBP1YDL122W 2430 nt1.99□□□□□ -2.09
GEP3Q08622 INO80YGL150C 4470 nt1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.4 ms