Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB2Q08289 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms