Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 snR79snR79 84 nt0.26□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.26□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 ISF1YMR081C 1017 nt0.26□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YPL080CYPL080C 327 nt0.26□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 DBP6YNR038W 1890 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 BFR2YDR299W 1605 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 PDE2YOR360C 1581 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 SRB7YDR308C 423 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YPR170CYPR170C 336 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 DAD1YDR016C 285 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YGR042WYGR042W 816 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YGR290WYGR290W 444 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 CMS1YLR003C 876 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 RPL37AYLR185W 267 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 SPR2YOR214C 711 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YDL152WYDL152W 366 nt0.23□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 GMC2YLR445W 567 nt0.23□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 SPC2YML055W 537 nt0.23□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 WAR1YML076C 2835 nt0.23□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.22□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 TDA2YER071C 381 nt0.22□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 LOC1YFR001W 615 nt0.22□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 ACF4YJR083C 930 nt0.22□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 ABF2YMR072W 552 nt0.22□□□□□ -2.37
LDB18Q07887 MYO1YHR023W 5787 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YSP1YHR155W 3687 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 snR84snR84 550 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 LCD1YDR499W 2244 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YMR321CYMR321C 318 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 SLI15YBR156C 2097 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 BIR1YJR089W 2865 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 HTB1YDR224C 396 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 QCR7YDR529C 384 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YHR054CYHR054C 1065 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 CHS6YJL099W 2241 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 SLY1YDR189W 2001 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 BEM3YPL115C 3387 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 MET32YDR253C 576 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YOL106WYOL106W 354 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YOR364WYOR364W 369 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YPR153WYPR153W 423 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 RRI2YOL117W 1938 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 MMS4YBR098W 2076 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 RPL26BYGR034W 384 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 RPS24BYIL069C 408 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.17□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 PPN1YDR452W 2025 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 PAN3YKL025C 2040 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 SPO23YBR250W 1572 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 LRP1YHR081W 555 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 UPS1YLR193C 528 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 YPR099CYPR099C 357 nt0.16□□□□□ -2.38
LDB18Q07887 STE5YDR103W 2754 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 ISD11YER048W-A 285 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 SBH1YER087C-B 249 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 COX3Q0275 810 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 NPR2YEL062W 1848 nt0.15□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 RRT1YBL048W 312 nt0.14□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 ALY2YJL084C 3141 nt0.13□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YDR008CYDR008C 351 nt0.13□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YDR114CYDR114C 303 nt0.13□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 TAD1YGL243W 1203 nt0.13□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 ENV11YGR071C 2583 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YDR220CYDR220C 294 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 RPC10YHR143W-A 213 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 POL32YJR043C 1053 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YKL111CYKL111C 336 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YNL150WYNL150W 408 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YPL197CYPL197C 414 nt0.12□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 TFB6YOR352W 1032 nt0.11□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 PMP1YCR024C-A 123 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YDR344CYDR344C 444 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YFR057WYFR057W 456 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 CUP1-1YHR053C 186 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 CUP1-2YHR055C 186 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 LIN1YHR156C 1023 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YBL062WYBL062W 381 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 IPI3YNL182C 1668 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 THO2YNL139C 4794 nt0.1□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 YLL032CYLL032C 2478 nt0.09□□□□□ -2.39
LDB18Q07887 CMC1YKL137W 336 nt0.09□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 RPL32YBL092W 393 nt0.09□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 NOP9YJL010C 2001 nt0.09□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YBR071WYBR071W 636 nt0.08□□□□□ -2.4
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