Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FMODQ06828 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms