Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 TRS65YGR166W 1683 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 NUM1YDR150W 8247 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YOL098CYOL098C 3114 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SCD5YOR329C 2619 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 RPL42BYHR141C 321 nt2.67□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 RPL42AYNL162W 321 nt2.67□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 HOS4YIL112W 3252 nt2.66□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YEL043WYEL043W 2871 nt2.66□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.66□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 RPH1YER169W 2391 nt2.66□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SLY1YDR189W 2001 nt2.66□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 GIS1YDR096W 2685 nt2.65□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SPO22YIL073C 2928 nt2.65□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 INP51YIL002C 2841 nt2.65□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YRB1YDR002W 606 nt2.65□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YJL150WYJL150W 303 nt2.65□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 ZRG8YER033C 3231 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 TFC3YAL001C 3483 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 GEA1YJR031C 4227 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 UBP15YMR304W 3693 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 INA22YIR024C 651 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YBL083CYBL083C 426 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 RPB10YOR210W 213 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 STB4YMR019W 2850 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 IRC8YJL051W 2469 nt2.64□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 PDR3YBL005W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 PRP39YML046W 1890 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YGR050CYGR050C 357 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 IRR1YIL026C 3453 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 VPS54YDR027C 2670 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 CBF2YGR140W 2871 nt2.63□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 UTP14YML093W 2700 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 CDC53YDL132W 2448 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YJL135WYJL135W 318 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YLR140WYLR140W 327 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YPR092WYPR092W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 SEC5YDR166C 2916 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 SLM1YIL105C 2061 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 AMS1YGL156W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 SWI5YDR146C 2130 nt2.62□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 MGM1YOR211C 2646 nt2.61□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 RFX1YLR176C 2436 nt2.61□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 SET2YJL168C 2202 nt2.61□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 SMY2YBR172C 2223 nt2.61□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YFR016CYFR016C 3702 nt2.61□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.6□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 UFD4YKL010C 4452 nt2.6□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 PDR11YIL013C 4236 nt2.6□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 CLN3YAL040C 1743 nt2.59□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 TRA1YHR099W 11235 nt2.59□□□□□ -1.99
HRQ1Q05549 YKU70YMR284W 1809 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YKU80YMR106C 1890 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 SWR1YDR334W 4545 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 EMP24YGL200C 612 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 VMR1YHL035C 4779 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 SAP185YJL098W 3177 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 VTC3YPL019C 2508 nt2.58□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YNL170WYNL170W 396 nt2.57□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YOR218CYOR218C 420 nt2.57□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YOR376WYOR376W 369 nt2.57□□□□□ -2
HRQ1Q05549 SCP160YJL080C 3669 nt2.56□□□□□ -2
HRQ1Q05549 snR72snR72 98 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 PHO2YDL106C 1680 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 SEC31YDL195W 3822 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 HYP2YEL034W 474 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YNL018CYNL018C 1839 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 SAP190YKR028W 3102 nt2.55□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YDR239CYDR239C 2364 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YCR043CYCR043C 384 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 RPS27BYHR021C 249 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 DGR1YNL130C-A 147 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YIL080WYIL080W 4722 nt2.54□□□□□ -2
HRQ1Q05549 LYS14YDR034C 2373 nt2.53□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.53□□□□□ -2
HRQ1Q05549 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.53□□□□□ -2
HRQ1Q05549 MPT5YGL178W 2580 nt2.53□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SSD1YDR293C 3753 nt2.52□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.52□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 NUP170YBL079W 4509 nt2.51□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 NIP100YPL174C 2607 nt2.51□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 YBL012CYBL012C 402 nt2.51□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 TRS130YMR218C 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 MRP10YDL045W-A 288 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 snR74snR74 88 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SRP14YDL092W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 YGL217CYGL217C 342 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 PAU8YAL068C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 PAU18YLL064C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 PAU6YNR076W 363 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 PAU20YOL161C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SGF11YPL047W 300 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 ACM1YPL267W 630 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SWA2YDR320C 2007 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 MCM10YIL150C 1716 nt2.5□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 APL5YPL195W 2799 nt2.49□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 IRA2YOL081W 9240 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73 ms