Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCZQ05513 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCZQ05513 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms