Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMX2Q04743 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMX2Q04743 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMX2Q04743 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMX2Q04743 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMX2Q04743 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMX2Q04743 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms