Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMX1Q04741 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms