Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms