Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYBPC1Q00872 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms