Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP1Q00587 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms