Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms