Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX1P83916 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX1P83916 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms